迟明
,
毕炜
,
卢庄
,
宋丽娜
,
贾伟
,
张养军
,
钱小红
,
蔡耘
色谱
二氧化钛富集法作为目前使用最为广泛的金属氧化物富集磷酸肽的方法,在富集过程中常常对富含天冬氨酸和谷氨酸的酸性非磷酸化肽段存在一定的非特异性吸附作用.这些肽段与磷酸化肽段一同被富集,降低了磷酸肽富集的选择性.传统方法中使用的非特异性吸附抑制剂常会对质谱的电喷雾离子源造成污染,因而限制了其在液相色谱-质谱联用(LC-MS)系统中的应用.本研究将天冬氨酸作为一种新型的非特异性吸附抑制剂加入到二氧化钛富集体系中,并分别对3种和9种标准蛋白质酶切肽段混合物进行富集实验,同时与添加另一种非特异性吸附抑制剂--谷氨酸以及不添加任何非特异性吸附抑制剂的富集体系进行了富集效果的比较.结果表明,天冬氨酸可以有效地提高二氧化钛对磷酸肽富集的选择性.将添加天冬氨酸的二氧化钛富集体系应用于鼠肝全蛋白质磷酸肽的富集中,同样取得了很好的效果,表明天冬氨酸在复杂的生物样本的磷酸肽富集中也同样具有良好的应用前景.此外,由于天冬氨酸在反相色谱中极易被洗脱去除,从而避免了传统抑制剂对LC-MS系统离子源的污染问题.
关键词:
二氧化钛
,
富集
,
非特异性吸附抑制剂
,
天冬氨酸
,
磷酸肽
,
鼠肝
王灼维
,
彭福利
,
王媛
,
童维
,
任艳
,
徐宁志
,
刘斯奇
色谱
膜蛋白质在变性剂作用下能够较充分地溶解.根据这一特点,我们试图在变性剂溶液中采用串联离子交换色谱法分离小鼠肝脏膜蛋白质.将小鼠肝脏膜蛋白质溶解于含有4 mol/L 尿素,20 mmol/L 三羟甲基氨基甲烷(Tris)-盐酸缓冲液(pH 9.0)中,用Q-Sepharose FF和Sephacryl S-200HR树脂组成的色谱柱结合大部分溶解的膜蛋白质,然后采用氯化钠线性梯度洗脱蛋白质,分步收集后采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进一步分离洗脱组分的蛋白质.利用胶内胰蛋白酶消化技术将SDS-PAGE胶内分离的蛋白质降解为相应的肽段,然后以反相高效液相色谱分离和离子阱质谱仪鉴定肽段.根据文献报道和蛋白质的功能分类,在所鉴定的392个蛋白质中有306个可能为膜蛋白质或膜结合蛋白质.蛋白质的疏水性计算表明,GRAVY(grand average of hydropathicity)得分大于或等于0.00的蛋白质有83个.综上所述,我们有理由认为本实验方法基本符合小鼠肝脏膜蛋白质组学研究的要求.
关键词:
多维离子交换色谱
,
十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳
,
反相高效液相色谱
,
串联质谱
,
膜蛋白质
,
小鼠肝脏
