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基于稳定同位素标记的蛋白质组学定量方法研究进展

周愿 , 单亦初 , 张丽华 , 张玉奎

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2013.05007

定量蛋白质组学已经成为后基因时代的重要研究方向之一.目前该领域的研究主要采用无标记定量方法和稳定同位素标记定量法.其中,基于稳定同位素标记的蛋白质组定量方法发展非常迅速,已为生命科学研究提供了重要的技术支撑.本文分析了基于稳定同位素标记的蛋白质组学定量方法,包括相对定量方法和绝对定量方法,并对其发展进行了展望.

关键词: 定量蛋白质组学 , 稳定同位素标记 , 相对定量 , 绝对定量

金属标记结合高效液相色谱-选择离子监测质谱的蛋白质绝对定量新方法

李佳斌 , 周廉淇 , 颜辉 , 李楠楠 , 郝斐然 , 田芳 , 张养军

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2013.11042

建立了金属标记结合高效液相色谱-选择性离子监测质谱(SIM)的蛋白质绝对定量新方法。实验考察了金属标记效率、金属标记的稳定性、标记后肽段的色谱保留和质谱行为、新定量方法的线性范围和准确度。实验结果表明金属标记具有标记效率高,稳定性好,色谱保留行为一致等优点。另外,金属标记-选择离子监测质谱绝对定量方法灵敏度高,其定量限低至1 fmol,线性范围为1~500 fmol,线性范围内 R2值大于0.99,具有良好的线性关系;经过测量,标准肽段的回收率为117.01%,说明该方法具有较高的准确度。将该方法应用于腾冲嗜热菌中烯醇酶蛋白的定量分析,相对标准偏差为5.47%,表明该方法的精密度高。以上结果表明该方法可以用于生物样本中的蛋白质的绝对定量分析,为比较简单的生物样本中蛋白质的绝对定量方法提供了一种新的选择。

关键词: 金属标记 , 高效液相色谱 , 选择离子监测质谱 , 蛋白质 , 绝对定量

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