王志鹏
色谱
doi:10.3724/SP.J.1123.2011.00335
建立了采用变性高效液相色谱(DHPLC)对α-血红蛋白稳定蛋白(AHSP)基因进行基因分型和突变筛查的新方法.将AHSP基因序列分成6个片段,因第一、二、四、六个片段均含有1～2个常见单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,需单个标本分别进行检测;第三、五个片段不含有常见SNP位点,采用DHPLC结合DNA(脱氧核糖核酸)池的方法进行检测.以基因测序为金标准对所建立的AHSP基因检测方法进行方法学评价,结果显示:40个样品的DHPLC检测结果与测序结果之间完全吻合,说明所建立的检测方法能对AHSP基因6种常见SNP进行准确基因分型.应用DHPLC对365个样品的AHSP基因进行检测,发现2个罕见SNP(11810G＞A和12 802 C＞T);同时还发现2个错义突变(AHSP D29V和AHSP V56G),AHSP D29V突变为新突变,AHSP V56G为罕见突变.结果表明采用DHPLC法可有效地对AHSP基因进行基因分型和突变筛查.
关键词:
变性高效液相色谱
,
α-血红蛋白稳定蛋白基因
,
基因分型
,
突变筛查
