赵静
,
朱祥伟
,
徐挺
,
尹大强
环境化学
doi:10.7524/j.issn.0254-6108.2015.07.2015020403
利用模式动物斑马鱼(Danio rerio)的运动行为实验,评价了在光照-黑暗周期刺激下BDE17(2,2’,4-tribromodiphenyl ether)和4’-OH-BDE17(4’-Hydroxy-2,2’,4-tribromodiphenyl ether)暴露对幼鱼运动行为效应,并利用分子对接技术和荧光素酶报告基因实验探讨了这两种化合物与斑马鱼视黄酸受体的相互作用关系,试图揭示运动行为效应的机制.BDE17暴露没有改变斑马鱼幼鱼的运动行为,而50 μg·L-1 4’-OH-BDE17暴露却造成斑马鱼幼鱼在光照和黑暗条件下均出现运动活跃现象.分子对接结果表明,BDE17和4'-OH-BDE17与斑马鱼视黄酸受体的结合能力都不如视黄酸(Retinoic acid,RA)强.荧光素酶报告基因实验结果表明,与对照组相比,50 μg·L-1 4’-OH-BDE17暴露组荧光素酶活性均显著增加(P＜0.05);而BDE17暴露组荧光素酶活性则无显著性差异.这表明4’-OH-BDE17通过直接与视黄酸受体(Retinoic acid receptors,RARs)结合来诱导视黄酸受体转录活性,而BDE17则不能直接与视黄酸受体发生相互作用.本研究结果表明4’-OH-BDE17暴露可能通过诱导视黄酸受体转录活性,干扰视黄酸动态平衡,造成神经系统发育损伤,进而改变斑马鱼幼鱼的运动行为,而BDE17暴露则不能.
关键词:
多溴联苯醚
,
斑马鱼
,
神经行为毒性
,
视黄酸受体
,
报告基因
,
分子对接
赵博
,
陶进
,
马吉胜
,
廉虹
,
王岩
,
常琳
,
高仁钧
,
曹淑桂
催化学报
通过定向进化的方法, 提高了一个新的源于枯草芽孢杆菌 (Bacillus subtilis) 的脂肪酶 (BSL2) 的活力. 经过两轮易错 PCR 以及高通量筛选, 最终获得了比活力为野生出发酶 4.5 倍的突变体 3-1B2. 基因比对结果表明, 共有两个氨基酸发生了突变. 突变酶的酶学性质研究发现, 与野生酶相比, 它的热稳定性及 pH 稳定性略有增加, 最适温度和最适 pH 值则无太大的变化. 同源模建了 BSL2 与 3-1B2 的结构, 并与底物进行了分子对接. 结果表明, 突变体 3-1B2 的结合能比野生型 BSL2 低 1.29 kcal/mol, 活性中心 Ser77 残基与底物羰基的距离也由 0.319 nm 减小为 0.278 nm, 因而加快了酶反应速度, 提高了酶活力.
关键词:
枯草芽孢杆菌
,
脂肪酶
,
易错聚合酶链反应
,
定向进化
,
分子对接
杨伟华
,
于红霞
,
王梦龙
环境化学
doi:10.7524/j.issn.0254-6108.2015.05.2014100803
应用分子对接方法探讨了多溴二苯醚（ PBDE）衍生物与人胎盘芳香化酶间的可能作用机理。通过分析对接生成的构象发现，羟基多溴二苯醚（ HO?PBDEs）和甲氧基多溴二苯醚（ MeO?PBDEs）与人胎盘芳香化酶间形成氢键的情况不同。对人胎盘芳香化酶有抑制活性的 HO?PBDEs 通过其羟基（—OH）与氨基酸残基Arg435、Arg115、Arg375、Asp309和Ala306形成氢键，而对人胎盘芳香化酶无抑制活性的MeO?PBDEs的甲氧基（ MeO—）几乎不与芳香化酶内氨基酸残基形成氢键，这可能是二者对芳香化酶抑制活性不同的原因。由此推测，化合物作为氢键供体可能是多溴二苯醚衍生物具有抑制芳香化酶活性的结构基础。本研究从化合物结构及化合物与人胎盘芳香化酶结合的构象特征上解释化合物活性不同的原因，以期能够利用构象分析得到的结果进行筛选。
关键词:
多溴二苯醚衍生物
,
芳香化酶
,
分子间作用
,
分子对接
秦孟楠
,
宋春磊
,
林志芬
,
孔令云
环境化学
doi:10.7524/j.issn.0254-6108.2016.01.2015070802
本文以蓝藻水华优势藻种——铜绿微囊藻和典型绿藻——羊角月牙藻为受试生物,测定了4种取代脲类除草剂对两种藻的96 h急性毒性,并初步探讨了引起毒性差异的原因.结果显示,4种取代脲类除草剂对羊角月牙藻的毒性均大于铜绿微囊藻.分子对接的结果表明,取代脲类除草剂与羊角月牙藻的D1蛋白的结合能力大于铜绿微囊藻,这可能是导致羊角月牙藻对取代脲类除草剂更加敏感的原因.同时,分子对接揭示了氯离子可以增加取代脲类除草剂的疏水性,从而使化合物更易接近活性位点内部的疏水区域,更易与相应的氨基酸形成氢键.
关键词:
铜绿微囊藻
,
羊角月牙藻
,
取代脲类除草剂
,
毒性
,
分子对接
