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液相色谱-串联质谱法同时测定生物组织全基因组DNA甲基化和羟甲基化水平

木晓丽 , 张洁 , 彭思远 , 王晓雪 , 申河清

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2014.03025

测定全基因组 DNA甲基化和羟甲基化水平对于研究环境污染物暴露的影响及致病机理具有重要的作用。本文建立了液相色谱-串联质谱( LC-MS/MS)同时测定动物组织中全基因组 DNA 甲基化和羟甲基化水平的方法。从动物组织样品中提取 DNA,并将其酶解成单核苷,利用液相色谱-串联质谱法测定5-甲基胞嘧啶核苷、5-羟甲基胞嘧啶核苷和鸟嘌呤核苷的含量,计算全基因组 DNA甲基化率和羟甲基化率。利用该方法研究了砷暴露对大鼠肝脏和小脑全基因组 DNA甲基化和羟甲基化水平的影响,得到了砷影响 DNA甲基化及羟甲基化的初步数据。该方法具有良好的重现性、灵敏度和稳定性,可以同时检测差异较大的 DNA 甲基化和羟甲基化水平。为同时研究DNA甲基化和羟甲基化水平提供了有力的支持。

关键词: 液相色谱-串联质谱 , 5-甲基胞嘧啶 , 5-羟甲基胞嘧啶 , 动物组织

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