基于支撑向量机方法的有机化合物的生成Gibbs自由能的预测

应用化学, 2006, 23(5): 552-556. doi: 10.3969/j.issn.1000-0518.2006.05.019

基于支撑向量机方法的有机化合物的生成Gibbs自由能的预测

王冰 ^1, , 刘焕香 ^2, , 姚小军 ^3, , 任月英 ^4, , 胡之德 ^5,

1.兰州大学化学化工学院,兰州,730000

2.兰州大学化学化工学院,兰州,730000

3.兰州大学化学化工学院,兰州,730000

4.兰州大学化学化工学院,兰州,730000

5.兰州大学化学化工学院,兰州,730000

关键词：支撑向量机 , 多元线形回归 , 吉布斯自由能

Prediction of Gibbs Free Energy of Formation of Organic Compounds Based on Support Vector Machines

用支撑向量机研究了607种有机化合物的结构和他们的Gibbs自由能的关系,建立了相应的QSPR模型. 表示分子结构的描述符是从CODESSA软件中计算得到的,通过前向逐步回归分析选择其中的13个描述符,多元线性回归(MLR)和支撑向量机(SVM)被分别用来构造线性和非线性模型预测有机化合物的Gibbs自由能. 支撑向量机方法得到的模型对整个数据集、训练集、测试集的平均绝对偏差分别为31.098 9、30.569 5和35.924 6 kJ/mol ,预测结果令人满意.

参考文献

[1]	Katritzky A R,Lobanov V S,Karelson M.CODESSA Version 2.0 Reference Manual[M],1995～1997
[2]	ISIS Draw2.3 MDL Information Systems Inc,1990
[3]	HyperChem,Release 4.0 for Windows,Hypercube,Inc,1995
[4]	Ding C H Q,Dubchak I.Bioinformatics[J],2001,17:349
[5]	Karchin R,Karplus K,Haussler D.Bioinformatics[J],2002,18:147
[6]	Cai Y D,Liu X J,Xu X B,et al.J Comput Chem[J],2002,23:267
[7]	Czerminski R,Yasri A,Hartsough D.Quant Struct-Act Relat[J],2001,20:227
[8]	Wang W J,Xu Z B,Lu W Z,et al.Neurocomputing[J],2003,55:643

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